缺铁胁迫下拟南芥新转录本的鉴定与克隆.doc

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摘要:铁是植物必需的微量元素,在植物体的光合作用、呼吸作用、固氮作用、蛋白质和核酸的合成等诸多生理代谢过程的电子传递连或酶促反应中发挥着极其重要的作用。由于各种原因,植物对铁的吸收和利用很低。探讨植物对铁的吸收,转运,分配机制有助于为培育富铁作物提供理论基础。缺铁胁迫会诱导很多基因特异表达,该过程是否有新转录本的产生还未见文献报道。本课题依据模式植物拟南芥叶片缺铁处理后的高通量转录组测序(RNA-Seq)数据,将重点分析鉴定缺铁处理后不同叶片中产生的新转录本。采用生物信息学手段进行分析,发现已注释基因AT2G44745上游位置产生一新转录本,在缺铁处理后的叶片中特异诱导表达,随后实验验证该转录本确实存在且正向转录,在此基础上扩增该转录本全长序列并成功构建了植物过表达载体,为转基因并进一步研究该新转录本的具体功能奠定了基础。

 

关键词:拟南芥;缺铁;新转录本;克隆

 

目录

摘要

Abstract

1.文献综述-1

 1.1 铁的作用-1

 1.2高等植物中铁的吸收机制-1

 1.3植物对铁的转运和分配机制-3

 1.4铁元素吸收系统的调控机制-3

 1.5新转录本-4

2.研究报告-5

 引言-5

 2.1技术路线-5

 2.2实验材料-6

 2.3实验仪器-6

 2.4实验试剂-6

 2.5实验方法-7

 2.6实验结果-13

 2.6.1拟南芥缺铁处理表型观察-13

 2.6.2 RNA-seq结果分析-14

 2.6.3 RT-PCR检测新转录本表达模式-15

 2.6.4扩增新转录本全长序列-16

 2.6.5植物过表达载体的构建-17

 2.7讨论-19

致谢-21

参考文献-22